Microbiote intestinal

Article principal : Microbiote.

Escherichia coli, une des nombreuses espèces de bactéries présente dans la « flore » intestinale.

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Le microbiote intestinal, également appelé flore intestinale, est l'ensemble des micro-organismes (archées, bactéries, eucaryotes) qui se trouvent dans le tube digestif des animaux. Cela comprend donc les bactéries de l'intestin et celles de l'estomac. La flore intestinale est un bon exemple de mutualisme : coopération entre différentes sortes d'organismes impliquant un avantage pour chacun.

Description

Humain

Article détaillé : Microbiote intestinal humain. Articles connexes : Microbiote intestinal et santé mentale et Axe intestin-cerveau.

Les avancées en matière de séquençage ont permis d'identifier les espèces dominantes du microbiote intestinal humain, de caractériser l'écosystème correspondant et d'aider au diagnostic de certaines pathologies.

Ruminants

Les ruminants hébergent une quantité très importante d'espèces symbiotes. La capacité à digérer la cellulose est due à des archées.

Insectes

Certains insectes sociaux pratiquent la trophallaxie — par exemple les fourmis ouvrières, les abeilles et les guêpes ouvrières pratiquent la trophallaxie stomodéale ; d’autres telles que les termites et les blattes du genre Cryptocercus (en) pratiquent la trophallaxie proctodéale —, ce qui a pour effet d’échanger et renouveler en partie leur flore intestinale.

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Entretien du microbiote intestinal

Articles détaillés : Prébiotique, Probiotique, Antibiotique, Coprophagie et Fermentation.